Space Empires: Starfury là tựa game đầu tiên được Malfador Machinations phát triển bằng cách sử dụng đồ họa 3D. Trò chơi ban đầu được lên kế hoạch làm bộ engine chiến đấu cho Space Empires V, nhưng đã quyết định rằng nó không đủ "sâu" cho mục đích đó. Thay vào đó, trò chơi phát triển thành một tựa game dựa trên một con tàu, được đặt trong vũ trụ Space Empires.[5]

Các nhà phát triển đã tạo ra trò chơi với ý tưởng rằng người chơi có thể dễ dàng sửa đổi trò chơi theo ý thích của mình.[7]